Евгений Чарушин родился 11 ноября 1901 года в Вятке. Его отец был архитектором, именно он обучал юного Евгения рисованию. С детства писателя окружала природа родного края, это способствовало тому, что у мальчика появился интерес к природе и способность наблюдать и подмечать детали.
Учился будущий писатель в гимназии, а после её окончания поступил в Академию художеств в Петербурге. Позднее он работал иллюстратором. Первым произведением, проиллюстрированным Евгением Ивановичем Чарушиным, стал рассказ Виталия Бианки.
Уже в 1930 году Евгений Иванович Чарушин при поддержке Самуила Яковлевича Маршака начал писать небольшие детские рассказы о природе и жизни животных, сопровождая их собственными иллюстрациями. Очень тепло о рассказах начинающего автора отозвался Максим Горький. Но это оказалось самым трудным делом в его жизни, так как по его собственному признанию, иллюстрировать чужие тексты ему было много проще, чем свои собственные. В своих текстах очень часто возникали споры между Чарушиным-писателем и Чарушиным-художником.
Всего за свою жизнь он проиллюстрировал более 100 детских книг.
В годы войны Чарушин жил в родном Кирове. Рисовал плакаты, оформлял спектакли в Кировском театре драмы. А еще расписал один из детских садов города и дом пионеров, превратив их в настоящее сказочное царство.
В 1945 году Евгений Иванович вернулся в Ленинград и снова работал над книгами и рисунками. В этом же году был удостоен звания Заслуженного деятеля искусств РСФСР.
Последней книжной работой были иллюстрации к «Деткам в клетке» Маршака. За нее он получил золотую медаль на Международной выставке детской книги в Лейпциге.
Умер писатель-художник 18 февраля 1965 года в Ленинграде.